Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY72

SCN3B, Sodium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN3BQ9NY72 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN3BQ9NY72 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN3BQ9NY72 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN3BQ9NY72 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN3BQ9NY72 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN3BQ9NY72 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN3BQ9NY72 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN3BQ9NY72 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN3BQ9NY72 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN3BQ9NY72 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN3BQ9NY72 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN3BQ9NY72 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN3BQ9NY72 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN3BQ9NY72 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN3BQ9NY72 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN3BQ9NY72 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN3BQ9NY72 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN3BQ9NY72 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN3BQ9NY72 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN3BQ9NY72 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN3BQ9NY72 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN3BQ9NY72 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN3BQ9NY72 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN3BQ9NY72 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN3BQ9NY72 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN3BQ9NY72 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN3BQ9NY72 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN3BQ9NY72 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN3BQ9NY72 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN3BQ9NY72 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN3BQ9NY72 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN3BQ9NY72 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN3BQ9NY72 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN3BQ9NY72 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN3BQ9NY72 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN3BQ9NY72 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN3BQ9NY72 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN3BQ9NY72 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN3BQ9NY72 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN3BQ9NY72 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN3BQ9NY72 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN3BQ9NY72 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN3BQ9NY72 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN3BQ9NY72 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN3BQ9NY72 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN3BQ9NY72 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN3BQ9NY72 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN3BQ9NY72 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN3BQ9NY72 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN3BQ9NY72 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN3BQ9NY72 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN3BQ9NY72 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN3BQ9NY72 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN3BQ9NY72 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN3BQ9NY72 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN3BQ9NY72 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN3BQ9NY72 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN3BQ9NY72 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN3BQ9NY72 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN3BQ9NY72 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN3BQ9NY72 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN3BQ9NY72 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN3BQ9NY72 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN3BQ9NY72 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN3BQ9NY72 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN3BQ9NY72 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN3BQ9NY72 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN3BQ9NY72 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms