Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL28Q9NXS3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL28Q9NXS3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL28Q9NXS3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL28Q9NXS3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL28Q9NXS3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL28Q9NXS3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL28Q9NXS3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL28Q9NXS3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL28Q9NXS3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL28Q9NXS3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL28Q9NXS3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL28Q9NXS3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL28Q9NXS3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL28Q9NXS3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL28Q9NXS3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL28Q9NXS3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL28Q9NXS3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL28Q9NXS3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL28Q9NXS3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL28Q9NXS3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL28Q9NXS3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL28Q9NXS3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL28Q9NXS3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL28Q9NXS3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL28Q9NXS3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL28Q9NXS3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL28Q9NXS3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL28Q9NXS3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL28Q9NXS3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL28Q9NXS3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL28Q9NXS3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL28Q9NXS3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL28Q9NXS3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL28Q9NXS3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL28Q9NXS3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL28Q9NXS3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL28Q9NXS3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL28Q9NXS3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL28Q9NXS3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL28Q9NXS3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL28Q9NXS3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL28Q9NXS3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL28Q9NXS3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL28Q9NXS3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL28Q9NXS3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL28Q9NXS3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL28Q9NXS3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL28Q9NXS3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL28Q9NXS3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL28Q9NXS3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL28Q9NXS3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL28Q9NXS3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL28Q9NXS3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL28Q9NXS3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL28Q9NXS3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms