Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD3AQ9NVI7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD3AQ9NVI7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD3AQ9NVI7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD3AQ9NVI7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD3AQ9NVI7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD3AQ9NVI7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATAD3AQ9NVI7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATAD3AQ9NVI7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATAD3AQ9NVI7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATAD3AQ9NVI7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATAD3AQ9NVI7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATAD3AQ9NVI7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATAD3AQ9NVI7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATAD3AQ9NVI7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATAD3AQ9NVI7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATAD3AQ9NVI7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATAD3AQ9NVI7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATAD3AQ9NVI7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATAD3AQ9NVI7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATAD3AQ9NVI7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATAD3AQ9NVI7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATAD3AQ9NVI7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATAD3AQ9NVI7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms