Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM30AQ9NV96 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM30AQ9NV96 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM30AQ9NV96 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM30AQ9NV96 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM30AQ9NV96 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM30AQ9NV96 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM30AQ9NV96 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM30AQ9NV96 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM30AQ9NV96 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM30AQ9NV96 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM30AQ9NV96 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM30AQ9NV96 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM30AQ9NV96 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM30AQ9NV96 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM30AQ9NV96 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM30AQ9NV96 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM30AQ9NV96 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM30AQ9NV96 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM30AQ9NV96 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM30AQ9NV96 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM30AQ9NV96 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM30AQ9NV96 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM30AQ9NV96 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM30AQ9NV96 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM30AQ9NV96 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM30AQ9NV96 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM30AQ9NV96 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM30AQ9NV96 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM30AQ9NV96 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM30AQ9NV96 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM30AQ9NV96 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM30AQ9NV96 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM30AQ9NV96 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM30AQ9NV96 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM30AQ9NV96 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM30AQ9NV96 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM30AQ9NV96 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM30AQ9NV96 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM30AQ9NV96 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM30AQ9NV96 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM30AQ9NV96 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM30AQ9NV96 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM30AQ9NV96 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM30AQ9NV96 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM30AQ9NV96 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM30AQ9NV96 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM30AQ9NV96 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM30AQ9NV96 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM30AQ9NV96 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM30AQ9NV96 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM30AQ9NV96 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM30AQ9NV96 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM30AQ9NV96 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM30AQ9NV96 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM30AQ9NV96 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM30AQ9NV96 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM30AQ9NV96 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM30AQ9NV96 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TMEM30AQ9NV96 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM30AQ9NV96 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM30AQ9NV96 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM30AQ9NV96 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM30AQ9NV96 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM30AQ9NV96 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM30AQ9NV96 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM30AQ9NV96 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM30AQ9NV96 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM30AQ9NV96 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM30AQ9NV96 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM30AQ9NV96 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM30AQ9NV96 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM30AQ9NV96 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM30AQ9NV96 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM30AQ9NV96 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM30AQ9NV96 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM30AQ9NV96 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM30AQ9NV96 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM30AQ9NV96 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM30AQ9NV96 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM30AQ9NV96 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM30AQ9NV96 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM30AQ9NV96 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM30AQ9NV96 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM30AQ9NV96 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM30AQ9NV96 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM30AQ9NV96 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms