Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IMP3Q9NV31 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IMP3Q9NV31 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IMP3Q9NV31 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IMP3Q9NV31 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IMP3Q9NV31 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IMP3Q9NV31 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IMP3Q9NV31 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IMP3Q9NV31 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IMP3Q9NV31 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IMP3Q9NV31 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IMP3Q9NV31 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IMP3Q9NV31 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IMP3Q9NV31 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IMP3Q9NV31 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IMP3Q9NV31 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IMP3Q9NV31 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
IMP3Q9NV31 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IMP3Q9NV31 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IMP3Q9NV31 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IMP3Q9NV31 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IMP3Q9NV31 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IMP3Q9NV31 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IMP3Q9NV31 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IMP3Q9NV31 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IMP3Q9NV31 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IMP3Q9NV31 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IMP3Q9NV31 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IMP3Q9NV31 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IMP3Q9NV31 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IMP3Q9NV31 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IMP3Q9NV31 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IMP3Q9NV31 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IMP3Q9NV31 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IMP3Q9NV31 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IMP3Q9NV31 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IMP3Q9NV31 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IMP3Q9NV31 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IMP3Q9NV31 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IMP3Q9NV31 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IMP3Q9NV31 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IMP3Q9NV31 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IMP3Q9NV31 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IMP3Q9NV31 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IMP3Q9NV31 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IMP3Q9NV31 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IMP3Q9NV31 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IMP3Q9NV31 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IMP3Q9NV31 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IMP3Q9NV31 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IMP3Q9NV31 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IMP3Q9NV31 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IMP3Q9NV31 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IMP3Q9NV31 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IMP3Q9NV31 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IMP3Q9NV31 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IMP3Q9NV31 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IMP3Q9NV31 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IMP3Q9NV31 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IMP3Q9NV31 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IMP3Q9NV31 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IMP3Q9NV31 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IMP3Q9NV31 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IMP3Q9NV31 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IMP3Q9NV31 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IMP3Q9NV31 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMP3Q9NV31 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMP3Q9NV31 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.4 ms