Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TDP1Q9NUW8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TDP1Q9NUW8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TDP1Q9NUW8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TDP1Q9NUW8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TDP1Q9NUW8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TDP1Q9NUW8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TDP1Q9NUW8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TDP1Q9NUW8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TDP1Q9NUW8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TDP1Q9NUW8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TDP1Q9NUW8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TDP1Q9NUW8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TDP1Q9NUW8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TDP1Q9NUW8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TDP1Q9NUW8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TDP1Q9NUW8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TDP1Q9NUW8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TDP1Q9NUW8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TDP1Q9NUW8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TDP1Q9NUW8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TDP1Q9NUW8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TDP1Q9NUW8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TDP1Q9NUW8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TDP1Q9NUW8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TDP1Q9NUW8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TDP1Q9NUW8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TDP1Q9NUW8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TDP1Q9NUW8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TDP1Q9NUW8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TDP1Q9NUW8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TDP1Q9NUW8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TDP1Q9NUW8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TDP1Q9NUW8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TDP1Q9NUW8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TDP1Q9NUW8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TDP1Q9NUW8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TDP1Q9NUW8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TDP1Q9NUW8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TDP1Q9NUW8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TDP1Q9NUW8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TDP1Q9NUW8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
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