Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GKN1Q9NS71 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GKN1Q9NS71 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GKN1Q9NS71 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GKN1Q9NS71 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GKN1Q9NS71 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GKN1Q9NS71 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GKN1Q9NS71 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GKN1Q9NS71 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GKN1Q9NS71 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GKN1Q9NS71 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GKN1Q9NS71 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GKN1Q9NS71 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GKN1Q9NS71 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GKN1Q9NS71 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GKN1Q9NS71 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GKN1Q9NS71 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GKN1Q9NS71 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GKN1Q9NS71 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GKN1Q9NS71 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GKN1Q9NS71 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GKN1Q9NS71 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GKN1Q9NS71 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GKN1Q9NS71 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GKN1Q9NS71 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GKN1Q9NS71 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GKN1Q9NS71 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GKN1Q9NS71 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GKN1Q9NS71 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GKN1Q9NS71 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GKN1Q9NS71 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GKN1Q9NS71 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GKN1Q9NS71 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GKN1Q9NS71 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GKN1Q9NS71 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GKN1Q9NS71 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GKN1Q9NS71 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GKN1Q9NS71 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GKN1Q9NS71 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GKN1Q9NS71 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GKN1Q9NS71 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GKN1Q9NS71 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GKN1Q9NS71 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GKN1Q9NS71 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GKN1Q9NS71 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GKN1Q9NS71 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GKN1Q9NS71 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GKN1Q9NS71 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GKN1Q9NS71 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GKN1Q9NS71 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GKN1Q9NS71 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GKN1Q9NS71 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GKN1Q9NS71 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GKN1Q9NS71 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GKN1Q9NS71 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GKN1Q9NS71 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GKN1Q9NS71 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GKN1Q9NS71 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GKN1Q9NS71 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GKN1Q9NS71 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GKN1Q9NS71 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GKN1Q9NS71 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GKN1Q9NS71 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GKN1Q9NS71 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GKN1Q9NS71 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GKN1Q9NS71 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GKN1Q9NS71 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GKN1Q9NS71 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GKN1Q9NS71 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GKN1Q9NS71 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GKN1Q9NS71 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GKN1Q9NS71 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GKN1Q9NS71 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GKN1Q9NS71 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GKN1Q9NS71 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GKN1Q9NS71 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GKN1Q9NS71 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GKN1Q9NS71 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GKN1Q9NS71 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GKN1Q9NS71 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms