Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TOPORSQ9NS56 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOPORSQ9NS56 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOPORSQ9NS56 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOPORSQ9NS56 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOPORSQ9NS56 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOPORSQ9NS56 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOPORSQ9NS56 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TOPORSQ9NS56 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOPORSQ9NS56 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOPORSQ9NS56 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOPORSQ9NS56 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TOPORSQ9NS56 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOPORSQ9NS56 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOPORSQ9NS56 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOPORSQ9NS56 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOPORSQ9NS56 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOPORSQ9NS56 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOPORSQ9NS56 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOPORSQ9NS56 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOPORSQ9NS56 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOPORSQ9NS56 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOPORSQ9NS56 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOPORSQ9NS56 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOPORSQ9NS56 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TOPORSQ9NS56 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOPORSQ9NS56 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPORSQ9NS56 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPORSQ9NS56 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPORSQ9NS56 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPORSQ9NS56 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPORSQ9NS56 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOPORSQ9NS56 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOPORSQ9NS56 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOPORSQ9NS56 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOPORSQ9NS56 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPORSQ9NS56 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPORSQ9NS56 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPORSQ9NS56 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPORSQ9NS56 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPORSQ9NS56 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPORSQ9NS56 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPORSQ9NS56 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPORSQ9NS56 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPORSQ9NS56 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPORSQ9NS56 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPORSQ9NS56 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPORSQ9NS56 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOPORSQ9NS56 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOPORSQ9NS56 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOPORSQ9NS56 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TOPORSQ9NS56 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOPORSQ9NS56 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOPORSQ9NS56 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOPORSQ9NS56 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TOPORSQ9NS56 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TOPORSQ9NS56 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOPORSQ9NS56 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOPORSQ9NS56 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOPORSQ9NS56 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOPORSQ9NS56 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOPORSQ9NS56 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOPORSQ9NS56 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOPORSQ9NS56 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOPORSQ9NS56 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOPORSQ9NS56 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOPORSQ9NS56 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOPORSQ9NS56 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPORSQ9NS56 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPORSQ9NS56 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPORSQ9NS56 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPORSQ9NS56 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPORSQ9NS56 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPORSQ9NS56 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPORSQ9NS56 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOPORSQ9NS56 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOPORSQ9NS56 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TOPORSQ9NS56 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms