Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBQLN4Q9NRR5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBQLN4Q9NRR5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBQLN4Q9NRR5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBQLN4Q9NRR5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBQLN4Q9NRR5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBQLN4Q9NRR5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBQLN4Q9NRR5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBQLN4Q9NRR5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBQLN4Q9NRR5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBQLN4Q9NRR5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBQLN4Q9NRR5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBQLN4Q9NRR5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBQLN4Q9NRR5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBQLN4Q9NRR5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBQLN4Q9NRR5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBQLN4Q9NRR5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBQLN4Q9NRR5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBQLN4Q9NRR5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBQLN4Q9NRR5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBQLN4Q9NRR5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBQLN4Q9NRR5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBQLN4Q9NRR5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBQLN4Q9NRR5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBQLN4Q9NRR5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBQLN4Q9NRR5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBQLN4Q9NRR5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBQLN4Q9NRR5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBQLN4Q9NRR5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBQLN4Q9NRR5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBQLN4Q9NRR5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBQLN4Q9NRR5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBQLN4Q9NRR5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBQLN4Q9NRR5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBQLN4Q9NRR5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBQLN4Q9NRR5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBQLN4Q9NRR5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBQLN4Q9NRR5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBQLN4Q9NRR5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBQLN4Q9NRR5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBQLN4Q9NRR5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBQLN4Q9NRR5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBQLN4Q9NRR5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBQLN4Q9NRR5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBQLN4Q9NRR5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBQLN4Q9NRR5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBQLN4Q9NRR5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms