Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR33

POLE4, DNA polymerase epsilon subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE4Q9NR33 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLE4Q9NR33 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLE4Q9NR33 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms