Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LHX9Q9NQ69 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LHX9Q9NQ69 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms