Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASCL3Q9NQ33 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASCL3Q9NQ33 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms