Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD87

C6orf50, Putative uncharacterized protein C6orf50, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf50Q9HD87 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C6orf50Q9HD87 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C6orf50Q9HD87 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C6orf50Q9HD87 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
C6orf50Q9HD87 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C6orf50Q9HD87 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
C6orf50Q9HD87 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C6orf50Q9HD87 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C6orf50Q9HD87 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C6orf50Q9HD87 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
C6orf50Q9HD87 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
C6orf50Q9HD87 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C6orf50Q9HD87 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C6orf50Q9HD87 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C6orf50Q9HD87 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C6orf50Q9HD87 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C6orf50Q9HD87 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C6orf50Q9HD87 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C6orf50Q9HD87 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C6orf50Q9HD87 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C6orf50Q9HD87 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C6orf50Q9HD87 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C6orf50Q9HD87 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C6orf50Q9HD87 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C6orf50Q9HD87 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C6orf50Q9HD87 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C6orf50Q9HD87 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C6orf50Q9HD87 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C6orf50Q9HD87 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C6orf50Q9HD87 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C6orf50Q9HD87 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C6orf50Q9HD87 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C6orf50Q9HD87 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C6orf50Q9HD87 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C6orf50Q9HD87 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
C6orf50Q9HD87 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
C6orf50Q9HD87 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C6orf50Q9HD87 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C6orf50Q9HD87 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C6orf50Q9HD87 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
C6orf50Q9HD87 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C6orf50Q9HD87 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C6orf50Q9HD87 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C6orf50Q9HD87 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C6orf50Q9HD87 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C6orf50Q9HD87 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
C6orf50Q9HD87 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C6orf50Q9HD87 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C6orf50Q9HD87 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C6orf50Q9HD87 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C6orf50Q9HD87 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
C6orf50Q9HD87 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C6orf50Q9HD87 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C6orf50Q9HD87 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C6orf50Q9HD87 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C6orf50Q9HD87 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C6orf50Q9HD87 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C6orf50Q9HD87 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C6orf50Q9HD87 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C6orf50Q9HD87 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C6orf50Q9HD87 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C6orf50Q9HD87 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C6orf50Q9HD87 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C6orf50Q9HD87 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C6orf50Q9HD87 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C6orf50Q9HD87 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C6orf50Q9HD87 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C6orf50Q9HD87 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
C6orf50Q9HD87 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C6orf50Q9HD87 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C6orf50Q9HD87 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C6orf50Q9HD87 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C6orf50Q9HD87 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C6orf50Q9HD87 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C6orf50Q9HD87 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
C6orf50Q9HD87 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C6orf50Q9HD87 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C6orf50Q9HD87 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C6orf50Q9HD87 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C6orf50Q9HD87 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
C6orf50Q9HD87 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C6orf50Q9HD87 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C6orf50Q9HD87 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C6orf50Q9HD87 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C6orf50Q9HD87 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C6orf50Q9HD87 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C6orf50Q9HD87 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C6orf50Q9HD87 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
C6orf50Q9HD87 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C6orf50Q9HD87 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C6orf50Q9HD87 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
C6orf50Q9HD87 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C6orf50Q9HD87 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C6orf50Q9HD87 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
C6orf50Q9HD87 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C6orf50Q9HD87 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C6orf50Q9HD87 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C6orf50Q9HD87 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C6orf50Q9HD87 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C6orf50Q9HD87 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms