Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRMS1Q9HCU9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRMS1Q9HCU9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRMS1Q9HCU9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRMS1Q9HCU9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRMS1Q9HCU9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRMS1Q9HCU9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRMS1Q9HCU9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRMS1Q9HCU9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRMS1Q9HCU9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRMS1Q9HCU9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRMS1Q9HCU9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRMS1Q9HCU9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRMS1Q9HCU9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRMS1Q9HCU9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRMS1Q9HCU9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRMS1Q9HCU9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRMS1Q9HCU9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRMS1Q9HCU9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRMS1Q9HCU9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRMS1Q9HCU9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRMS1Q9HCU9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRMS1Q9HCU9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRMS1Q9HCU9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRMS1Q9HCU9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BRMS1Q9HCU9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BRMS1Q9HCU9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BRMS1Q9HCU9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
BRMS1Q9HCU9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRMS1Q9HCU9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRMS1Q9HCU9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRMS1Q9HCU9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRMS1Q9HCU9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRMS1Q9HCU9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRMS1Q9HCU9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRMS1Q9HCU9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRMS1Q9HCU9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRMS1Q9HCU9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRMS1Q9HCU9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRMS1Q9HCU9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRMS1Q9HCU9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRMS1Q9HCU9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRMS1Q9HCU9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRMS1Q9HCU9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRMS1Q9HCU9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRMS1Q9HCU9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRMS1Q9HCU9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRMS1Q9HCU9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRMS1Q9HCU9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRMS1Q9HCU9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BRMS1Q9HCU9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRMS1Q9HCU9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRMS1Q9HCU9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BRMS1Q9HCU9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRMS1Q9HCU9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRMS1Q9HCU9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRMS1Q9HCU9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRMS1Q9HCU9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRMS1Q9HCU9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRMS1Q9HCU9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRMS1Q9HCU9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRMS1Q9HCU9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRMS1Q9HCU9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRMS1Q9HCU9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRMS1Q9HCU9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRMS1Q9HCU9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
BRMS1Q9HCU9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms