Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTN4Q9HB63 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTN4Q9HB63 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms