Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y2

RPF1, Ribosome production factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF1Q9H9Y2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPF1Q9H9Y2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPF1Q9H9Y2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPF1Q9H9Y2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPF1Q9H9Y2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RPF1Q9H9Y2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPF1Q9H9Y2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPF1Q9H9Y2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPF1Q9H9Y2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPF1Q9H9Y2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPF1Q9H9Y2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPF1Q9H9Y2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPF1Q9H9Y2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPF1Q9H9Y2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPF1Q9H9Y2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPF1Q9H9Y2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPF1Q9H9Y2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPF1Q9H9Y2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPF1Q9H9Y2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPF1Q9H9Y2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RPF1Q9H9Y2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPF1Q9H9Y2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPF1Q9H9Y2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPF1Q9H9Y2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPF1Q9H9Y2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPF1Q9H9Y2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPF1Q9H9Y2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPF1Q9H9Y2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPF1Q9H9Y2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPF1Q9H9Y2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPF1Q9H9Y2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPF1Q9H9Y2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPF1Q9H9Y2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RPF1Q9H9Y2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPF1Q9H9Y2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPF1Q9H9Y2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPF1Q9H9Y2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPF1Q9H9Y2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPF1Q9H9Y2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPF1Q9H9Y2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPF1Q9H9Y2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPF1Q9H9Y2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPF1Q9H9Y2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPF1Q9H9Y2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPF1Q9H9Y2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPF1Q9H9Y2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPF1Q9H9Y2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPF1Q9H9Y2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPF1Q9H9Y2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPF1Q9H9Y2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RPF1Q9H9Y2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPF1Q9H9Y2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPF1Q9H9Y2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPF1Q9H9Y2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPF1Q9H9Y2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPF1Q9H9Y2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPF1Q9H9Y2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPF1Q9H9Y2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RPF1Q9H9Y2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPF1Q9H9Y2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPF1Q9H9Y2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPF1Q9H9Y2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPF1Q9H9Y2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPF1Q9H9Y2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPF1Q9H9Y2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPF1Q9H9Y2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms