Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S5

FKRP, Fukutin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FKRPQ9H9S5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FKRPQ9H9S5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms