Protein–RNA interactions for Protein: Q9H902

REEP1, Receptor expression-enhancing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP1Q9H902 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REEP1Q9H902 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
REEP1Q9H902 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REEP1Q9H902 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REEP1Q9H902 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
REEP1Q9H902 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
REEP1Q9H902 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
REEP1Q9H902 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REEP1Q9H902 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REEP1Q9H902 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REEP1Q9H902 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
REEP1Q9H902 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REEP1Q9H902 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
REEP1Q9H902 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
REEP1Q9H902 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
REEP1Q9H902 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms