Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP13A3Q9H7F0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP13A3Q9H7F0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP13A3Q9H7F0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP13A3Q9H7F0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP13A3Q9H7F0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP13A3Q9H7F0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP13A3Q9H7F0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP13A3Q9H7F0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP13A3Q9H7F0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP13A3Q9H7F0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP13A3Q9H7F0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP13A3Q9H7F0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP13A3Q9H7F0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP13A3Q9H7F0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP13A3Q9H7F0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP13A3Q9H7F0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP13A3Q9H7F0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP13A3Q9H7F0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP13A3Q9H7F0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP13A3Q9H7F0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP13A3Q9H7F0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP13A3Q9H7F0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP13A3Q9H7F0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP13A3Q9H7F0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP13A3Q9H7F0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP13A3Q9H7F0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP13A3Q9H7F0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP13A3Q9H7F0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP13A3Q9H7F0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP13A3Q9H7F0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP13A3Q9H7F0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP13A3Q9H7F0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP13A3Q9H7F0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP13A3Q9H7F0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP13A3Q9H7F0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP13A3Q9H7F0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP13A3Q9H7F0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP13A3Q9H7F0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP13A3Q9H7F0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP13A3Q9H7F0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP13A3Q9H7F0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP13A3Q9H7F0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP13A3Q9H7F0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP13A3Q9H7F0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP13A3Q9H7F0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP13A3Q9H7F0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP13A3Q9H7F0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP13A3Q9H7F0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP13A3Q9H7F0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP13A3Q9H7F0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP13A3Q9H7F0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP13A3Q9H7F0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP13A3Q9H7F0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP13A3Q9H7F0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP13A3Q9H7F0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP13A3Q9H7F0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP13A3Q9H7F0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP13A3Q9H7F0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP13A3Q9H7F0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP13A3Q9H7F0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP13A3Q9H7F0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP13A3Q9H7F0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP13A3Q9H7F0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP13A3Q9H7F0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP13A3Q9H7F0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP13A3Q9H7F0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP13A3Q9H7F0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP13A3Q9H7F0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP13A3Q9H7F0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP13A3Q9H7F0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP13A3Q9H7F0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP13A3Q9H7F0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A3Q9H7F0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A3Q9H7F0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A3Q9H7F0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A3Q9H7F0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP13A3Q9H7F0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP13A3Q9H7F0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP13A3Q9H7F0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP13A3Q9H7F0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP13A3Q9H7F0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP13A3Q9H7F0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP13A3Q9H7F0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP13A3Q9H7F0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP13A3Q9H7F0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP13A3Q9H7F0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP13A3Q9H7F0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP13A3Q9H7F0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP13A3Q9H7F0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP13A3Q9H7F0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP13A3Q9H7F0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP13A3Q9H7F0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP13A3Q9H7F0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP13A3Q9H7F0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP13A3Q9H7F0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP13A3Q9H7F0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP13A3Q9H7F0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP13A3Q9H7F0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP13A3Q9H7F0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms