Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L7

SMARCAD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAD1Q9H4L7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCAD1Q9H4L7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCAD1Q9H4L7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCAD1Q9H4L7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCAD1Q9H4L7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCAD1Q9H4L7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCAD1Q9H4L7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCAD1Q9H4L7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCAD1Q9H4L7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCAD1Q9H4L7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCAD1Q9H4L7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCAD1Q9H4L7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCAD1Q9H4L7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCAD1Q9H4L7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCAD1Q9H4L7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCAD1Q9H4L7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCAD1Q9H4L7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCAD1Q9H4L7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCAD1Q9H4L7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCAD1Q9H4L7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCAD1Q9H4L7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCAD1Q9H4L7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCAD1Q9H4L7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCAD1Q9H4L7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCAD1Q9H4L7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SMARCAD1Q9H4L7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCAD1Q9H4L7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCAD1Q9H4L7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCAD1Q9H4L7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms