Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
SENP3Q9H4L4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
SENP3Q9H4L4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SENP3Q9H4L4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SENP3Q9H4L4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SENP3Q9H4L4 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SENP3Q9H4L4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SENP3Q9H4L4 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SENP3Q9H4L4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
SENP3Q9H4L4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SENP3Q9H4L4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SENP3Q9H4L4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SENP3Q9H4L4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SENP3Q9H4L4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SENP3Q9H4L4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SENP3Q9H4L4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
SENP3Q9H4L4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
SENP3Q9H4L4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SENP3Q9H4L4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SENP3Q9H4L4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SENP3Q9H4L4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SENP3Q9H4L4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SENP3Q9H4L4 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SENP3Q9H4L4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SENP3Q9H4L4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SENP3Q9H4L4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
SENP3Q9H4L4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
SENP3Q9H4L4 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SENP3Q9H4L4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SENP3Q9H4L4 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SENP3Q9H4L4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SENP3Q9H4L4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SENP3Q9H4L4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.34
SENP3Q9H4L4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
SENP3Q9H4L4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SENP3Q9H4L4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SENP3Q9H4L4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SENP3Q9H4L4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SENP3Q9H4L4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SENP3Q9H4L4 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SENP3Q9H4L4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SENP3Q9H4L4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SENP3Q9H4L4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SENP3Q9H4L4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SENP3Q9H4L4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
SENP3Q9H4L4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SENP3Q9H4L4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SENP3Q9H4L4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SENP3Q9H4L4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SENP3Q9H4L4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
SENP3Q9H4L4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SENP3Q9H4L4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SENP3Q9H4L4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SENP3Q9H4L4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SENP3Q9H4L4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SENP3Q9H4L4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SENP3Q9H4L4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SENP3Q9H4L4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SENP3Q9H4L4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SENP3Q9H4L4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SENP3Q9H4L4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SENP3Q9H4L4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SENP3Q9H4L4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
SENP3Q9H4L4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
SENP3Q9H4L4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SENP3Q9H4L4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SENP3Q9H4L4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
SENP3Q9H4L4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.1 ms