Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S3

TMPRSS5, Transmembrane protease serine 5, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS5Q9H3S3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMPRSS5Q9H3S3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMPRSS5Q9H3S3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMPRSS5Q9H3S3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMPRSS5Q9H3S3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMPRSS5Q9H3S3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMPRSS5Q9H3S3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMPRSS5Q9H3S3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMPRSS5Q9H3S3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPRSS5Q9H3S3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPRSS5Q9H3S3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPRSS5Q9H3S3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPRSS5Q9H3S3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPRSS5Q9H3S3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPRSS5Q9H3S3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMPRSS5Q9H3S3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMPRSS5Q9H3S3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMPRSS5Q9H3S3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMPRSS5Q9H3S3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPRSS5Q9H3S3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPRSS5Q9H3S3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMPRSS5Q9H3S3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMPRSS5Q9H3S3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMPRSS5Q9H3S3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMPRSS5Q9H3S3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms