Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W6

MRPL46, 39S ribosomal protein L46, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL46Q9H2W6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL46Q9H2W6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL46Q9H2W6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL46Q9H2W6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL46Q9H2W6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL46Q9H2W6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL46Q9H2W6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL46Q9H2W6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL46Q9H2W6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL46Q9H2W6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL46Q9H2W6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL46Q9H2W6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL46Q9H2W6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL46Q9H2W6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL46Q9H2W6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL46Q9H2W6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL46Q9H2W6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL46Q9H2W6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms