Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDCL3Q9H2J4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDCL3Q9H2J4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDCL3Q9H2J4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDCL3Q9H2J4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDCL3Q9H2J4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDCL3Q9H2J4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PDCL3Q9H2J4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDCL3Q9H2J4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDCL3Q9H2J4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDCL3Q9H2J4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDCL3Q9H2J4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDCL3Q9H2J4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCL3Q9H2J4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCL3Q9H2J4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCL3Q9H2J4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCL3Q9H2J4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCL3Q9H2J4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCL3Q9H2J4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDCL3Q9H2J4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDCL3Q9H2J4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDCL3Q9H2J4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDCL3Q9H2J4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDCL3Q9H2J4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDCL3Q9H2J4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDCL3Q9H2J4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDCL3Q9H2J4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDCL3Q9H2J4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDCL3Q9H2J4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDCL3Q9H2J4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDCL3Q9H2J4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDCL3Q9H2J4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDCL3Q9H2J4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDCL3Q9H2J4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDCL3Q9H2J4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDCL3Q9H2J4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDCL3Q9H2J4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDCL3Q9H2J4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDCL3Q9H2J4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDCL3Q9H2J4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDCL3Q9H2J4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDCL3Q9H2J4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDCL3Q9H2J4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDCL3Q9H2J4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDCL3Q9H2J4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDCL3Q9H2J4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PDCL3Q9H2J4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDCL3Q9H2J4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDCL3Q9H2J4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PDCL3Q9H2J4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDCL3Q9H2J4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDCL3Q9H2J4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms