Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA6AQ9H2E6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA6AQ9H2E6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6AQ9H2E6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6AQ9H2E6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6AQ9H2E6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6AQ9H2E6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6AQ9H2E6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6AQ9H2E6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6AQ9H2E6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6AQ9H2E6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6AQ9H2E6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6AQ9H2E6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6AQ9H2E6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6AQ9H2E6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6AQ9H2E6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6AQ9H2E6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA6AQ9H2E6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA6AQ9H2E6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA6AQ9H2E6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA6AQ9H2E6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6AQ9H2E6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6AQ9H2E6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6AQ9H2E6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6AQ9H2E6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6AQ9H2E6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6AQ9H2E6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA6AQ9H2E6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA6AQ9H2E6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA6AQ9H2E6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms