Protein–RNA interactions for Protein: Q9H195

MUC3B, Mucin-3B (Fragments), humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3BQ9H195 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MUC3BQ9H195 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MUC3BQ9H195 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MUC3BQ9H195 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MUC3BQ9H195 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MUC3BQ9H195 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MUC3BQ9H195 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MUC3BQ9H195 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MUC3BQ9H195 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MUC3BQ9H195 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MUC3BQ9H195 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MUC3BQ9H195 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MUC3BQ9H195 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MUC3BQ9H195 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MUC3BQ9H195 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MUC3BQ9H195 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MUC3BQ9H195 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MUC3BQ9H195 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MUC3BQ9H195 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MUC3BQ9H195 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MUC3BQ9H195 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MUC3BQ9H195 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MUC3BQ9H195 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MUC3BQ9H195 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MUC3BQ9H195 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MUC3BQ9H195 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MUC3BQ9H195 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MUC3BQ9H195 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MUC3BQ9H195 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MUC3BQ9H195 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MUC3BQ9H195 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MUC3BQ9H195 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MUC3BQ9H195 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MUC3BQ9H195 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MUC3BQ9H195 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MUC3BQ9H195 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MUC3BQ9H195 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MUC3BQ9H195 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MUC3BQ9H195 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MUC3BQ9H195 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MUC3BQ9H195 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MUC3BQ9H195 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MUC3BQ9H195 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MUC3BQ9H195 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MUC3BQ9H195 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MUC3BQ9H195 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MUC3BQ9H195 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MUC3BQ9H195 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MUC3BQ9H195 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MUC3BQ9H195 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MUC3BQ9H195 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MUC3BQ9H195 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MUC3BQ9H195 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MUC3BQ9H195 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MUC3BQ9H195 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MUC3BQ9H195 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MUC3BQ9H195 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MUC3BQ9H195 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MUC3BQ9H195 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MUC3BQ9H195 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MUC3BQ9H195 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MUC3BQ9H195 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MUC3BQ9H195 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MUC3BQ9H195 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MUC3BQ9H195 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUC3BQ9H195 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUC3BQ9H195 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUC3BQ9H195 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUC3BQ9H195 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms