Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSP1Q9GZU7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSP1Q9GZU7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSP1Q9GZU7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSP1Q9GZU7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSP1Q9GZU7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSP1Q9GZU7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSP1Q9GZU7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSP1Q9GZU7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSP1Q9GZU7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSP1Q9GZU7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSP1Q9GZU7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSP1Q9GZU7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTDSP1Q9GZU7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTDSP1Q9GZU7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTDSP1Q9GZU7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms