Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms