Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2J2Q9GZM3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2J2Q9GZM3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2J2Q9GZM3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2J2Q9GZM3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2J2Q9GZM3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2J2Q9GZM3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2J2Q9GZM3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2J2Q9GZM3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2J2Q9GZM3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2J2Q9GZM3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2J2Q9GZM3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2J2Q9GZM3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2J2Q9GZM3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2J2Q9GZM3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2J2Q9GZM3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2J2Q9GZM3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2J2Q9GZM3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2J2Q9GZM3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2J2Q9GZM3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2J2Q9GZM3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2J2Q9GZM3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2J2Q9GZM3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2J2Q9GZM3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2J2Q9GZM3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms