Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT23Q9C075 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT23Q9C075 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT23Q9C075 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT23Q9C075 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT23Q9C075 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT23Q9C075 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT23Q9C075 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT23Q9C075 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT23Q9C075 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT23Q9C075 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT23Q9C075 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT23Q9C075 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT23Q9C075 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT23Q9C075 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT23Q9C075 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT23Q9C075 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT23Q9C075 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT23Q9C075 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT23Q9C075 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT23Q9C075 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT23Q9C075 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT23Q9C075 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT23Q9C075 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT23Q9C075 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT23Q9C075 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT23Q9C075 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT23Q9C075 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT23Q9C075 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT23Q9C075 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT23Q9C075 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT23Q9C075 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT23Q9C075 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT23Q9C075 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT23Q9C075 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT23Q9C075 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT23Q9C075 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT23Q9C075 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT23Q9C075 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT23Q9C075 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT23Q9C075 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT23Q9C075 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT23Q9C075 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT23Q9C075 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT23Q9C075 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT23Q9C075 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT23Q9C075 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT23Q9C075 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT23Q9C075 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT23Q9C075 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT23Q9C075 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT23Q9C075 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT23Q9C075 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT23Q9C075 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT23Q9C075 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT23Q9C075 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT23Q9C075 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT23Q9C075 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT23Q9C075 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT23Q9C075 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT23Q9C075 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT23Q9C075 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT23Q9C075 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
KRT23Q9C075 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT23Q9C075 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT23Q9C075 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT23Q9C075 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT23Q9C075 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT23Q9C075 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT23Q9C075 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT23Q9C075 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT23Q9C075 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT23Q9C075 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT23Q9C075 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT23Q9C075 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT23Q9C075 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT23Q9C075 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT23Q9C075 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT23Q9C075 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT23Q9C075 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT23Q9C075 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT23Q9C075 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT23Q9C075 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT23Q9C075 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT23Q9C075 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT23Q9C075 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT23Q9C075 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT23Q9C075 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT23Q9C075 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT23Q9C075 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT23Q9C075 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT23Q9C075 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT23Q9C075 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT23Q9C075 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT23Q9C075 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT23Q9C075 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT23Q9C075 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT23Q9C075 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT23Q9C075 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT23Q9C075 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms