Protein–RNA interactions for Protein: Q9C004

SPRY4, Protein sprouty homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY4Q9C004 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPRY4Q9C004 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPRY4Q9C004 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPRY4Q9C004 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPRY4Q9C004 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPRY4Q9C004 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPRY4Q9C004 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPRY4Q9C004 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPRY4Q9C004 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPRY4Q9C004 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPRY4Q9C004 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPRY4Q9C004 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPRY4Q9C004 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SPRY4Q9C004 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPRY4Q9C004 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPRY4Q9C004 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPRY4Q9C004 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPRY4Q9C004 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPRY4Q9C004 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPRY4Q9C004 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPRY4Q9C004 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPRY4Q9C004 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPRY4Q9C004 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SPRY4Q9C004 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPRY4Q9C004 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPRY4Q9C004 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPRY4Q9C004 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPRY4Q9C004 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPRY4Q9C004 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPRY4Q9C004 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPRY4Q9C004 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms