Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TM6SF1Q9BZW5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TM6SF1Q9BZW5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TM6SF1Q9BZW5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TM6SF1Q9BZW5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TM6SF1Q9BZW5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TM6SF1Q9BZW5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TM6SF1Q9BZW5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TM6SF1Q9BZW5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TM6SF1Q9BZW5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TM6SF1Q9BZW5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TM6SF1Q9BZW5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TM6SF1Q9BZW5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TM6SF1Q9BZW5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TM6SF1Q9BZW5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TM6SF1Q9BZW5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TM6SF1Q9BZW5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TM6SF1Q9BZW5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TM6SF1Q9BZW5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TM6SF1Q9BZW5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TM6SF1Q9BZW5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TM6SF1Q9BZW5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TM6SF1Q9BZW5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TM6SF1Q9BZW5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TM6SF1Q9BZW5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TM6SF1Q9BZW5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TM6SF1Q9BZW5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TM6SF1Q9BZW5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TM6SF1Q9BZW5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TM6SF1Q9BZW5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TM6SF1Q9BZW5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TM6SF1Q9BZW5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TM6SF1Q9BZW5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TM6SF1Q9BZW5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TM6SF1Q9BZW5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TM6SF1Q9BZW5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TM6SF1Q9BZW5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TM6SF1Q9BZW5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TM6SF1Q9BZW5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TM6SF1Q9BZW5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TM6SF1Q9BZW5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TM6SF1Q9BZW5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TM6SF1Q9BZW5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TM6SF1Q9BZW5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
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