Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTPBP4Q9BZE4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTPBP4Q9BZE4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTPBP4Q9BZE4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTPBP4Q9BZE4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GTPBP4Q9BZE4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTPBP4Q9BZE4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTPBP4Q9BZE4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTPBP4Q9BZE4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTPBP4Q9BZE4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTPBP4Q9BZE4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GTPBP4Q9BZE4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTPBP4Q9BZE4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GTPBP4Q9BZE4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTPBP4Q9BZE4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms