Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG5

PARD6B, Partitioning defective 6 homolog beta, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6BQ9BYG5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARD6BQ9BYG5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PARD6BQ9BYG5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms