Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB1

LGR4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR4Q9BXB1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LGR4Q9BXB1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR4Q9BXB1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms