Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV94

EDEM2, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM2Q9BV94 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EDEM2Q9BV94 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDEM2Q9BV94 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDEM2Q9BV94 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDEM2Q9BV94 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDEM2Q9BV94 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDEM2Q9BV94 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDEM2Q9BV94 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDEM2Q9BV94 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDEM2Q9BV94 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDEM2Q9BV94 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM2Q9BV94 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM2Q9BV94 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM2Q9BV94 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM2Q9BV94 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM2Q9BV94 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM2Q9BV94 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM2Q9BV94 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM2Q9BV94 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM2Q9BV94 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM2Q9BV94 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDEM2Q9BV94 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDEM2Q9BV94 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDEM2Q9BV94 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EDEM2Q9BV94 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDEM2Q9BV94 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDEM2Q9BV94 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDEM2Q9BV94 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDEM2Q9BV94 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDEM2Q9BV94 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDEM2Q9BV94 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDEM2Q9BV94 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDEM2Q9BV94 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDEM2Q9BV94 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDEM2Q9BV94 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDEM2Q9BV94 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EDEM2Q9BV94 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDEM2Q9BV94 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDEM2Q9BV94 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDEM2Q9BV94 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDEM2Q9BV94 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms