Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THUMPD3Q9BV44 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THUMPD3Q9BV44 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THUMPD3Q9BV44 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THUMPD3Q9BV44 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
THUMPD3Q9BV44 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THUMPD3Q9BV44 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THUMPD3Q9BV44 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THUMPD3Q9BV44 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
THUMPD3Q9BV44 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THUMPD3Q9BV44 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THUMPD3Q9BV44 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
THUMPD3Q9BV44 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THUMPD3Q9BV44 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THUMPD3Q9BV44 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THUMPD3Q9BV44 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THUMPD3Q9BV44 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THUMPD3Q9BV44 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD3Q9BV44 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD3Q9BV44 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD3Q9BV44 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD3Q9BV44 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD3Q9BV44 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD3Q9BV44 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD3Q9BV44 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD3Q9BV44 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD3Q9BV44 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
THUMPD3Q9BV44 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
THUMPD3Q9BV44 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THUMPD3Q9BV44 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD3Q9BV44 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms