Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MKNK1Q9BUB5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKNK1Q9BUB5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MKNK1Q9BUB5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MKNK1Q9BUB5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MKNK1Q9BUB5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MKNK1Q9BUB5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MKNK1Q9BUB5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MKNK1Q9BUB5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MKNK1Q9BUB5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MKNK1Q9BUB5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MKNK1Q9BUB5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MKNK1Q9BUB5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MKNK1Q9BUB5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MKNK1Q9BUB5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MKNK1Q9BUB5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MKNK1Q9BUB5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKNK1Q9BUB5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MKNK1Q9BUB5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MKNK1Q9BUB5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKNK1Q9BUB5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKNK1Q9BUB5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKNK1Q9BUB5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKNK1Q9BUB5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKNK1Q9BUB5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKNK1Q9BUB5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKNK1Q9BUB5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKNK1Q9BUB5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MKNK1Q9BUB5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms