Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRFN3Q9BTN0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRFN3Q9BTN0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRFN3Q9BTN0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRFN3Q9BTN0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRFN3Q9BTN0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRFN3Q9BTN0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRFN3Q9BTN0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRFN3Q9BTN0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRFN3Q9BTN0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRFN3Q9BTN0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRFN3Q9BTN0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRFN3Q9BTN0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRFN3Q9BTN0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRFN3Q9BTN0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRFN3Q9BTN0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRFN3Q9BTN0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRFN3Q9BTN0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRFN3Q9BTN0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRFN3Q9BTN0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRFN3Q9BTN0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRFN3Q9BTN0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRFN3Q9BTN0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRFN3Q9BTN0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRFN3Q9BTN0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRFN3Q9BTN0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRFN3Q9BTN0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRFN3Q9BTN0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRFN3Q9BTN0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRFN3Q9BTN0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRFN3Q9BTN0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRFN3Q9BTN0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRFN3Q9BTN0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRFN3Q9BTN0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRFN3Q9BTN0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRFN3Q9BTN0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms