Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RIOK1Q9BRS2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RIOK1Q9BRS2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RIOK1Q9BRS2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RIOK1Q9BRS2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RIOK1Q9BRS2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RIOK1Q9BRS2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RIOK1Q9BRS2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RIOK1Q9BRS2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RIOK1Q9BRS2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RIOK1Q9BRS2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RIOK1Q9BRS2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RIOK1Q9BRS2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RIOK1Q9BRS2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RIOK1Q9BRS2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RIOK1Q9BRS2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RIOK1Q9BRS2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RIOK1Q9BRS2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RIOK1Q9BRS2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
RIOK1Q9BRS2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RIOK1Q9BRS2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RIOK1Q9BRS2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RIOK1Q9BRS2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RIOK1Q9BRS2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RIOK1Q9BRS2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RIOK1Q9BRS2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RIOK1Q9BRS2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RIOK1Q9BRS2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RIOK1Q9BRS2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RIOK1Q9BRS2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RIOK1Q9BRS2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RIOK1Q9BRS2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RIOK1Q9BRS2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RIOK1Q9BRS2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RIOK1Q9BRS2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RIOK1Q9BRS2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RIOK1Q9BRS2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RIOK1Q9BRS2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RIOK1Q9BRS2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RIOK1Q9BRS2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RIOK1Q9BRS2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RIOK1Q9BRS2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RIOK1Q9BRS2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RIOK1Q9BRS2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RIOK1Q9BRS2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RIOK1Q9BRS2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RIOK1Q9BRS2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RIOK1Q9BRS2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RIOK1Q9BRS2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RIOK1Q9BRS2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RIOK1Q9BRS2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RIOK1Q9BRS2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RIOK1Q9BRS2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RIOK1Q9BRS2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RIOK1Q9BRS2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RIOK1Q9BRS2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RIOK1Q9BRS2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RIOK1Q9BRS2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RIOK1Q9BRS2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RIOK1Q9BRS2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RIOK1Q9BRS2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RIOK1Q9BRS2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RIOK1Q9BRS2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RIOK1Q9BRS2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RIOK1Q9BRS2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RIOK1Q9BRS2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RIOK1Q9BRS2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RIOK1Q9BRS2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RIOK1Q9BRS2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RIOK1Q9BRS2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RIOK1Q9BRS2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RIOK1Q9BRS2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RIOK1Q9BRS2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RIOK1Q9BRS2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RIOK1Q9BRS2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RIOK1Q9BRS2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RIOK1Q9BRS2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RIOK1Q9BRS2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RIOK1Q9BRS2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RIOK1Q9BRS2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RIOK1Q9BRS2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RIOK1Q9BRS2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RIOK1Q9BRS2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RIOK1Q9BRS2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RIOK1Q9BRS2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RIOK1Q9BRS2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RIOK1Q9BRS2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RIOK1Q9BRS2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RIOK1Q9BRS2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RIOK1Q9BRS2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RIOK1Q9BRS2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RIOK1Q9BRS2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RIOK1Q9BRS2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RIOK1Q9BRS2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RIOK1Q9BRS2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RIOK1Q9BRS2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RIOK1Q9BRS2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RIOK1Q9BRS2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RIOK1Q9BRS2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RIOK1Q9BRS2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms