Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ83

SLX1A, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1AQ9BQ83 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLX1AQ9BQ83 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX1AQ9BQ83 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX1AQ9BQ83 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX1AQ9BQ83 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX1AQ9BQ83 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX1AQ9BQ83 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLX1AQ9BQ83 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLX1AQ9BQ83 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLX1AQ9BQ83 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLX1AQ9BQ83 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLX1AQ9BQ83 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX1AQ9BQ83 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX1AQ9BQ83 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX1AQ9BQ83 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX1AQ9BQ83 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX1AQ9BQ83 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLX1AQ9BQ83 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLX1AQ9BQ83 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLX1AQ9BQ83 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLX1AQ9BQ83 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLX1AQ9BQ83 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLX1AQ9BQ83 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLX1AQ9BQ83 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLX1AQ9BQ83 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX1AQ9BQ83 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX1AQ9BQ83 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX1AQ9BQ83 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX1AQ9BQ83 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms