Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOL4Q9BPW4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOL4Q9BPW4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOL4Q9BPW4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOL4Q9BPW4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOL4Q9BPW4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOL4Q9BPW4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOL4Q9BPW4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOL4Q9BPW4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOL4Q9BPW4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOL4Q9BPW4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOL4Q9BPW4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOL4Q9BPW4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOL4Q9BPW4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOL4Q9BPW4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOL4Q9BPW4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOL4Q9BPW4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APOL4Q9BPW4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOL4Q9BPW4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOL4Q9BPW4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APOL4Q9BPW4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOL4Q9BPW4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOL4Q9BPW4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms