Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VGLL1Q99990 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VGLL1Q99990 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VGLL1Q99990 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VGLL1Q99990 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL1Q99990 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms