Protein–RNA interactions for Protein: Q99758

ABCA3, ATP-binding cassette sub-family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA3Q99758 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCA3Q99758 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCA3Q99758 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCA3Q99758 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCA3Q99758 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCA3Q99758 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCA3Q99758 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCA3Q99758 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCA3Q99758 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCA3Q99758 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCA3Q99758 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCA3Q99758 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ABCA3Q99758 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ABCA3Q99758 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ABCA3Q99758 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ABCA3Q99758 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ABCA3Q99758 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ABCA3Q99758 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ABCA3Q99758 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
ABCA3Q99758 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ABCA3Q99758 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
ABCA3Q99758 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCA3Q99758 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCA3Q99758 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCA3Q99758 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCA3Q99758 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCA3Q99758 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCA3Q99758 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCA3Q99758 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCA3Q99758 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ABCA3Q99758 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ABCA3Q99758 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ABCA3Q99758 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
ABCA3Q99758 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ABCA3Q99758 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ABCA3Q99758 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ABCA3Q99758 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCA3Q99758 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCA3Q99758 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ABCA3Q99758 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ABCA3Q99758 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ABCA3Q99758 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
ABCA3Q99758 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ABCA3Q99758 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.81■■■■□ 3
ABCA3Q99758 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ABCA3Q99758 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
ABCA3Q99758 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ABCA3Q99758 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ABCA3Q99758 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
ABCA3Q99758 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ABCA3Q99758 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ABCA3Q99758 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ABCA3Q99758 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ABCA3Q99758 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
ABCA3Q99758 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ABCA3Q99758 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
ABCA3Q99758 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
ABCA3Q99758 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ABCA3Q99758 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCA3Q99758 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCA3Q99758 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCA3Q99758 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCA3Q99758 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCA3Q99758 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCA3Q99758 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCA3Q99758 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCA3Q99758 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCA3Q99758 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCA3Q99758 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCA3Q99758 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCA3Q99758 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCA3Q99758 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCA3Q99758 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCA3Q99758 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCA3Q99758 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCA3Q99758 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCA3Q99758 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCA3Q99758 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCA3Q99758 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCA3Q99758 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
ABCA3Q99758 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCA3Q99758 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ABCA3Q99758 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCA3Q99758 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCA3Q99758 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCA3Q99758 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCA3Q99758 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCA3Q99758 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCA3Q99758 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCA3Q99758 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCA3Q99758 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCA3Q99758 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCA3Q99758 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCA3Q99758 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCA3Q99758 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCA3Q99758 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCA3Q99758 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCA3Q99758 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCA3Q99758 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCA3Q99758 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms