Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPAS2Q99743 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPAS2Q99743 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPAS2Q99743 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPAS2Q99743 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPAS2Q99743 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NPAS2Q99743 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPAS2Q99743 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPAS2Q99743 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPAS2Q99743 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPAS2Q99743 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPAS2Q99743 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPAS2Q99743 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPAS2Q99743 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPAS2Q99743 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPAS2Q99743 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPAS2Q99743 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPAS2Q99743 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPAS2Q99743 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPAS2Q99743 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPAS2Q99743 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPAS2Q99743 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPAS2Q99743 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPAS2Q99743 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPAS2Q99743 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPAS2Q99743 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NPAS2Q99743 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPAS2Q99743 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPAS2Q99743 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NPAS2Q99743 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NPAS2Q99743 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms