Protein–RNA interactions for Protein: Q99677

LPAR4, Lysophosphatidic acid receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAR4Q99677 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPAR4Q99677 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPAR4Q99677 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPAR4Q99677 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPAR4Q99677 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPAR4Q99677 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPAR4Q99677 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPAR4Q99677 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPAR4Q99677 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPAR4Q99677 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPAR4Q99677 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPAR4Q99677 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPAR4Q99677 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPAR4Q99677 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LPAR4Q99677 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LPAR4Q99677 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LPAR4Q99677 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LPAR4Q99677 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LPAR4Q99677 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LPAR4Q99677 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LPAR4Q99677 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPAR4Q99677 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPAR4Q99677 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LPAR4Q99677 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPAR4Q99677 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LPAR4Q99677 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPAR4Q99677 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPAR4Q99677 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPAR4Q99677 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LPAR4Q99677 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LPAR4Q99677 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LPAR4Q99677 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LPAR4Q99677 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LPAR4Q99677 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LPAR4Q99677 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LPAR4Q99677 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.1 ms