Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDCA3Q99618 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDCA3Q99618 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDCA3Q99618 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDCA3Q99618 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDCA3Q99618 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDCA3Q99618 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDCA3Q99618 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CDCA3Q99618 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDCA3Q99618 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CDCA3Q99618 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDCA3Q99618 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDCA3Q99618 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDCA3Q99618 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDCA3Q99618 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDCA3Q99618 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDCA3Q99618 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDCA3Q99618 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDCA3Q99618 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CDCA3Q99618 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDCA3Q99618 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDCA3Q99618 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDCA3Q99618 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDCA3Q99618 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDCA3Q99618 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CDCA3Q99618 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CDCA3Q99618 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDCA3Q99618 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDCA3Q99618 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CDCA3Q99618 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA3Q99618 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA3Q99618 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA3Q99618 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA3Q99618 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA3Q99618 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA3Q99618 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA3Q99618 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA3Q99618 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDCA3Q99618 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDCA3Q99618 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDCA3Q99618 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDCA3Q99618 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDCA3Q99618 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDCA3Q99618 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDCA3Q99618 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDCA3Q99618 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDCA3Q99618 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDCA3Q99618 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDCA3Q99618 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CDCA3Q99618 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDCA3Q99618 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDCA3Q99618 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDCA3Q99618 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDCA3Q99618 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA3Q99618 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA3Q99618 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA3Q99618 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA3Q99618 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA3Q99618 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA3Q99618 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA3Q99618 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA3Q99618 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA3Q99618 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA3Q99618 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA3Q99618 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA3Q99618 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms