Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PSMD1Q99460 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PSMD1Q99460 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PSMD1Q99460 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PSMD1Q99460 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PSMD1Q99460 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PSMD1Q99460 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PSMD1Q99460 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PSMD1Q99460 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PSMD1Q99460 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PSMD1Q99460 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PSMD1Q99460 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
PSMD1Q99460 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PSMD1Q99460 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PSMD1Q99460 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PSMD1Q99460 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PSMD1Q99460 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PSMD1Q99460 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PSMD1Q99460 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PSMD1Q99460 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PSMD1Q99460 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PSMD1Q99460 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PSMD1Q99460 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PSMD1Q99460 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PSMD1Q99460 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PSMD1Q99460 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PSMD1Q99460 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PSMD1Q99460 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PSMD1Q99460 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PSMD1Q99460 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PSMD1Q99460 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PSMD1Q99460 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PSMD1Q99460 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PSMD1Q99460 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PSMD1Q99460 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PSMD1Q99460 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PSMD1Q99460 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PSMD1Q99460 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PSMD1Q99460 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PSMD1Q99460 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PSMD1Q99460 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PSMD1Q99460 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PSMD1Q99460 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PSMD1Q99460 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PSMD1Q99460 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PSMD1Q99460 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PSMD1Q99460 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PSMD1Q99460 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PSMD1Q99460 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PSMD1Q99460 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PSMD1Q99460 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PSMD1Q99460 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PSMD1Q99460 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PSMD1Q99460 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PSMD1Q99460 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PSMD1Q99460 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PSMD1Q99460 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PSMD1Q99460 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PSMD1Q99460 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PSMD1Q99460 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PSMD1Q99460 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PSMD1Q99460 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PSMD1Q99460 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PSMD1Q99460 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PSMD1Q99460 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PSMD1Q99460 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PSMD1Q99460 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PSMD1Q99460 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PSMD1Q99460 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PSMD1Q99460 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PSMD1Q99460 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PSMD1Q99460 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PSMD1Q99460 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PSMD1Q99460 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PSMD1Q99460 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PSMD1Q99460 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PSMD1Q99460 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PSMD1Q99460 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PSMD1Q99460 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PSMD1Q99460 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PSMD1Q99460 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PSMD1Q99460 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PSMD1Q99460 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSMD1Q99460 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
PSMD1Q99460 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSMD1Q99460 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PSMD1Q99460 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PSMD1Q99460 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSMD1Q99460 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSMD1Q99460 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSMD1Q99460 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSMD1Q99460 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSMD1Q99460 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSMD1Q99460 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PSMD1Q99460 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
PSMD1Q99460 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PSMD1Q99460 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PSMD1Q99460 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PSMD1Q99460 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PSMD1Q99460 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms