Protein–RNA interactions for Protein: Q96T21

SECISBP2, Selenocysteine insertion sequence-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SECISBP2Q96T21 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SECISBP2Q96T21 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SECISBP2Q96T21 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SECISBP2Q96T21 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SECISBP2Q96T21 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SECISBP2Q96T21 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SECISBP2Q96T21 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SECISBP2Q96T21 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SECISBP2Q96T21 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SECISBP2Q96T21 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SECISBP2Q96T21 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SECISBP2Q96T21 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SECISBP2Q96T21 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SECISBP2Q96T21 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SECISBP2Q96T21 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SECISBP2Q96T21 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SECISBP2Q96T21 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SECISBP2Q96T21 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SECISBP2Q96T21 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SECISBP2Q96T21 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SECISBP2Q96T21 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SECISBP2Q96T21 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SECISBP2Q96T21 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SECISBP2Q96T21 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms