Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK5RAP2Q96SN8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK5RAP2Q96SN8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CDK5RAP2Q96SN8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK5RAP2Q96SN8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK5RAP2Q96SN8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK5RAP2Q96SN8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK5RAP2Q96SN8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK5RAP2Q96SN8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK5RAP2Q96SN8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK5RAP2Q96SN8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK5RAP2Q96SN8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK5RAP2Q96SN8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK5RAP2Q96SN8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK5RAP2Q96SN8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDK5RAP2Q96SN8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDK5RAP2Q96SN8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK5RAP2Q96SN8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK5RAP2Q96SN8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDK5RAP2Q96SN8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDK5RAP2Q96SN8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDK5RAP2Q96SN8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDK5RAP2Q96SN8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDK5RAP2Q96SN8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK5RAP2Q96SN8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CDK5RAP2Q96SN8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK5RAP2Q96SN8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDK5RAP2Q96SN8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDK5RAP2Q96SN8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDK5RAP2Q96SN8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDK5RAP2Q96SN8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CDK5RAP2Q96SN8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK5RAP2Q96SN8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK5RAP2Q96SN8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK5RAP2Q96SN8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK5RAP2Q96SN8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms